Na stronie internetowej dziennika „Gazeta Wyborcza” (Gazeta.wyborcza.pl) w dniu 4 czerwca 2011 r. został opublikowany wywiad redaktora Jacka Harłukowicza z Józefem Piniorem, noszący tytuł „Pinior: O więzieniach CIA wiedział też PiS”1 W wywiadzie tym Józef Pinior poinformował o istnieniu dokumentu podpisanego przez Leszka Millera, będącego instrukcją regulującą istnienie na terytorium Polski tajnego więzienia CIA, w którym przetrzymywano i torturowano osoby podejrzewane o działalność terrorystyczną. Dodatkowo Józef Pinior zaznaczył, że istnieje stenogram ze spotkania byłego Ministra-Koordynatora Służb Specjalnych Zbigniewa Wassermanna z Ministrem Sprawiedliwości Zbigniewem Ziobro dotyczącego wspomnianego dokumentu.

Wystąpiliśmy więc o udostępnienie informacji publicznej w postaci potwierdzenia informacji, czy ww. dokumenty – instrukcja lub stenogram ze spotkania znajdują się w archiwach prokuratury, w tym w aktach sprawy prowadzonej przez Prokuraturę Apelacyjną w Warszawie pod sygn. Ap V Ds. 37/09.

W odpowiedzi na powyższy wniosek Prokuratura Apelacyja wystosowała pismo z dnia 8 lipca 2011 r., w którym odmówiła udzielenia wnioskowanych informacji. Prokuratura stwierdziła, że przepisy ustawy o dostępie do informacji publicznej nie mają zastosowania do toczącego się postępowania przygotowawczego.

W piśmie Polskiej Agencji Żeglugi Powietrznej z dnia 2 czerwca 2010 r., stanowiącym odpowiedź na wniosek o udostępnienie informacji publicznej Helsińskiej Fundacji Praw Człowieka z dnia 27 maja 2010 r. Polska Agencja Żeglugi Powietrznej przekazała dane, z których wynika, że  w 2005 roku samolot N63MU był w Polsce jeden raz: przyleciał 28 lipca 2005 r. z Kabulu do Warszawy, a 29 lipca 2005 r. odleciał do Keflaviku. W związku z powyższym zwróciliśmy się o udostępnienie informacji dotyczących kontroli ww. samolotu przeprowadzonej przez Straż Graniczną na lotnisku w Warszawie, w szczególności wystąpiliśmy o podanie: